Da die betroffene Szene eine relativ wichtige Stelle gegen Ende des Films darstellt, verstecke ich das lieber mal in einem Spoiler...
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In MiB wurden Zeitreisen zunächst scheinbar so gehandhabt, dass die "neuere" Person zur alten Zeit zurück springt und dort dann parallel zum früheren Selbst existiert. Das sehen wir daran, dass sowohl Boris doppelt vorkommt, als auch J selbst sich als kleinen Jungen sieht. Eine Zeitreise fällt allerdings aus dem Schema. J lässt sich von Boris abschießen, um dann einen kleinen Zeitsprung zu machen und diesen Schüssen auszuweichen. Die beiden machen auch den Zeitsprung gemeinsam, allerdings sind sie diesmal nicht noch einmal zusätzlich vorhanden, sondern gehen zu ihren vorherigen Zustand zurück. Wir haben hier also nicht irgendeins der vielen paradoxe Zeitsprung-Situationen, sondern eine Inkonsistenz bei der Funktionsweise der Zeitreisen.