In Arulco, dem Ort der Handlung des Spiels hat das feindliche Regime in Summe 4 Basen mit Boden-Luft-Raketen (inkl. jener in der Hauptstadt Meduna) und kann anfangs dadruch fast den kompletten Luftraum kontrollieren was zum einen verhindert dass man weiteres Personal von außen nur ganz im Norden einfliegen lassen kann und andererseits auch der möglicherweise im Lauf des Spiels gefundene abtrünnige Pilot der sich einem anschließt nicht sicher mit dem Transporthelikopter herumfliegen kann um Kämpfer rasch von A nach B zu bringen.
Der Logikfehler ergibt sich aber in Folge dessen wenn man es schafft eine oder mehrere dieser Basen zu erobern und dem Regime somit "wegzunehmen" - inkl. der Hoheit über den Teil des Luftraums: Da das Regime über keinerlei Flugeinheiten verfügt, passt es überhaupt nicht was bei der Eroberung der Raketenbasis von der Rebellin Ira angekündigt wird wenn diese dabei ist: "Vielleicht können wir die Basis ohne Lärm zu machen einnehmen bevor sie die Raketen entschärfen" (oder so ähnlich - aber genauso sinngemäß)
Was bitte soll es bringen die Soldaten daran zu hindern die Raketen zu "entschärfen"? - Wenn man die Basis einnimmt und die Raketen nutzbar sind/wären hätte man keinerlei Ziele in der Luf auf die man schießen könnte.
Zudem wäre es generell von Vorteil wenn man, wenn eine Eroberung einer Basis gelingt die Raketen bzw. Abschussvorrichtungen zerstören könnte, denn dann würde man es sich auch sparen diese Basen mit eigens auszubildender Miliz permanent halten zu müssen, damit sie nicht später wieder in die Hände der feinldichen Regierungstruppen fallen können.
Beides - sowohl der Kommentar beim Angriff auf die erste Basis als auch die Tatsache dass man dann Raketenbasen hält, nur damit sie der Feind nicht nutzen kann; aber dennoch nicht zerstört oder sabotiert rührt vermutlich daher dass das Spiel ursprünglich weitere Elemente wie zB Luftangriffe des Regimes gehabt hätte, die dann aber im Lauf der Entwicklung aus spieltechnischen Gründen entfernt wurden.,
Im Into-Movie des Spiels sieht man zB noch ein Kampfflugzeug des Regimes das Bomben abwirft - ebenso wie herumfahrende Panzer oder feindliche Geländewagen die ebenfalls im Spiel selbst nirgends auftauchen. (Panzer nur in der Hauptstadt und dort komplett statisch von Sandsäcken umgeben und somit nicht mobil wie man sie im Intro sieht)